Alors qu'Eileen a modifié la géographie de Fiore grâce au sortilège Universe One, afin d'écourter le conflit, une petite fille apparaît et se présente comme la première fée.
Lucy et ses compagnons doivent arrêter Acnologia qui est réapparu alors qu'ils le croyaient prisonnier de l'interstice temporel. Il arrive à dissocier son esprit de son corps et ce dernier détruit tout sur son passage. Fin de la série.
Acnologia surgit au cours de l'affrontement entre les camps de Natsu et Zeleph. Erza, Wendy et Gerald sont en mauvaise posture quand apparaît une personne qui sait comment vaincre le dragon maléfique.
Erza et Eileen s'affrontent, pendant que Gildarts fait face à August, le plus fort des Spriggan Twelve. Mavis s'active sur le front et Natsu a recouvré ses esprits. Zeleph, quant à lui, voit apparaître un guerrier couvert de blessures.
Alors que le conflit fait rage, Natsu s'affaiblit, cherchant dans les limbes de sa conscience sa mémoire perdue, tandis que Rahkeid immobilise les forces en présence grâce à sa magie blanche capable de manipuler les désirs. Dans le même temps, Erza fait face aux révélations d'Eileen.
Natsu part à la recherche de Zeleph mais Grey se dresse sur son passage. L'affrontement entre les deux garçons, dont le destin a été bouleversé par le magicien noir, commence.
Tandis que la guerre fait rage entre l'armée d'Arbaless et la guilde de Fairy Tail, Brandish propose d'être la messagère des mages afin de négocier pour eux le retrait des troupes ennemies.
Manga Aventure, action, magie. - La confusion règne à Magnoria. Wendy et Cherrya sont en difficulté face à la magicienne Dimaria, et Jacob fait disparaître tous les membres de la guilde.
Manga Aventure, action, magie. - La grande bataille entre Natsu et Zeleph continue et la situation des deux armées évolue. Lamia Scale et Mermaid Heel, au sud, sont sur le point d'être vaincus tandis que les Mages sacrés affrontent l'Ange de la destruction à l'est et que Saber Tooth et Blue Pegasus ont dû battre en retraite au nord.
Manga Aventure, action, magie. - La grande armée de l'empire d'Arbaless, conduite par les Douze Guerriers, envahit toute la Magnoria. A l'ouest, c'est Ajil qui est le premier à attaquer. Erza a beaucoup de mal à l'arrêter, à cause de la magie puissante du roi des sables, et cela n'annonce rien de bon.
Manga Aventure, action, magie. - Makarof, le grand maître de la guilde, a été sauvé. Luxus et la bande de Raijin sont de retour. Tous les membres de Fairy Tail sont rassemblés et solidaires face à la grande bataille qui les attend contre l'empire d'Arbaless de Zeleph.
Manga Aventure, action, magie. Trafzer et Tempester semblent avoir l'avantage dans le combat qui les oppose à Gajil et à Natsu, mais ces derniers sont pleins de ressources et bénéficient d'un allié inespéré.
Manga Aventure, action, magie. Alors que les membres de Fairy Tail affrontent ceux de la Porte des Neuf Démons, Silver enlève Grey et le provoque en duel, en lui révélant sa véritable identité et le destin qui les lie l'un à l'autre. Les deux mages de glace s'affrontent dans un combat dont l'issue pourrait bien ne pas dépendre d'eux.
Manga Aventure, action, magie. La lutte se poursuit entre Fairy Tail et Tartaros. Mais Mald Gheel, le roi des Enfers, intervient et modifie le cours de la bataille en lançant un maléfice qui transforme la base de Tartaros en Pluton Grim, véritable prison vivante qui retient prisonniers tous les membres de Fairy Tail. Tous sauf un.
Manga Aventure, action, magie. Natsu, Erza, Mirajane et Lisana réussissent à se libérer et contre-attaquent, pendant que le reste de la guilde prend d'assaut la base de Tartaros. C'est alors que Zeleph, le puissant mage noir, apparaît à Natsu.
Manga Aventure, action, magie. Suite du tournoi pour les équipes de Fairy Tail, qui remontent progressivement dans le classement et dans l'estime des spectateurs.
Manga Aventure, action, magie. Alors que le tournoi commence très mal pour Fairy Tail, avec ses deux équipes dernières du classement dès la première journée, la suite s'annonce heureusement mieux...
Manga Aventure, action, magie. De retour sur l'île de Tenro après 7 ans Natsu et ses compagnons découvrent que Fairy Tail est la plus faible des guildes de Fiore. En participant au grand tournoi de magie ils comprennent aussi qu'en n'évoluant pas pendant leur absence ils ont pris du retard.
Manga Aventure, action, magie. La violence de Tartaros se déchaîne contre les conseillers actuels, ainsi que sur les anciens membres du Conseil. Fairy Tail se charge de leur protection. Les membres de la guilde sont envoyés à travers tout le pays pour affronter les maléfices.
Manga Aventure, action, magie. Tandis que Frea est de retour chez elle, Natsu et ses amis se reposent et Minerva rentre à Succubus Eye. Mais les membres de Tartaros, menaçant la tranquillité du monde de la magie, ont provoqué un séisme qui a ravagé les lieux et causé la mort de neuf conseillers. Dranbalt, sorti sauf, rend visite à Cobra d'Oracion Seis en prison et découvre que ses ennemis sont des démons du Livre de Zeleph.
Manga Aventure, action, magie. Erza est redevenue une enfant en cherchant l'origine de la glace qui recouvre le village du Soleil. Natsu et les autres doivent affronter des chasseurs de trésors venus s'emparer de la Flamme éternelle. Personne ne se doute que Minerva et Frea sont aussi sur place.
Manga Aventure, action, magie. Gajil conduit un groupe de chasseurs dans le cimetière qu'il a découvert, où ils entendront une partie de l'histoire des dragons et d'Acnologia. Mais Arcadios les rejoint et leur révèle la véritable nature du plan Eclipse.
Manga Aventure, action, magie. Lucy termine deuxième de l'épreuve aquatique mais Fairy Tail éprouve toujours de la rancoeur envers Saber Tooth. Les organisateurs du tournoi décident la réunion des équipes A et B et seuls les membres les plus forts de la guilde peuvent continuer. Natsu et Gajil affrontent Sting et Rog. C'est l'occasion de venger Lucy et l'honneur de la guilde.
Manga Aventure, action, magie. Alors que la lutte entre dragons et magiciens fait rage, Lucy découvre que la destruction de la porte d'Eclipse pourrait arrêter la déferlante des monstres.
Manga Aventure, action, magie. Natsu et ses compagnons doivent affronter Hades pendant que Jubia cherche à reprendre Zeleph, l'objet convoité par les Grimoire Heart.
Manga Aventure, action, magie. Tandis que les membres de Fairy Tail tentent de reformer la guilde, Natsu parvient à résoudre les deux grandes énigmes concernant la dissolution du groupe et les raisons de l'absence de Makarof.
Manga Aventure, action, magie. La dernière épreuve du grand tournoi de la magie vient d'être révélée. Mais, dans les coulisses de la fête, la Lucy venue du futur décrit un avenir bien sombre et le retour des dragons : Natsu et ses amis doivent agir afin de trouver un moyen d'y échapper.